Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops5O35864 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops5O35864 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops5O35864 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops5O35864 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops5O35864 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops5O35864 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops5O35864 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops5O35864 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms