Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf9O35739 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms