Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx1aO35526 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx1aO35526 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms