Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pitx3O35160 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitx3O35160 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms