Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casq1O09165 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casq1O09165 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casq1O09165 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casq1O09165 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casq1O09165 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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