Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eftud2O08810 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms