Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms