Protein–RNA interactions for Protein: K7N769

2410141K09Rik, RIKEN cDNA 2410141K09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2410141K09RikK7N769 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2410141K09RikK7N769 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
2410141K09RikK7N769 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2410141K09RikK7N769 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
2410141K09RikK7N769 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms