Protein–RNA interactions for Protein: K7N608

Vmn1r78, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r78K7N608 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r78K7N608 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r78K7N608 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms