Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm9602J3QPD5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm9602J3QPD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9602J3QPD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms