Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21972J3QN38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms