Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21060J3KMU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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