Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp17lcG5E8I7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17lcG5E8I7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17lcG5E8I7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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