Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r167G3UW71 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms