Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm10378F6XQQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10378F6XQQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms