Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pagr1bF6V0H0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1bF6V0H0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms