Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933403O08RikF6UK53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933403O08RikF6UK53 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms