Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28305F6U473 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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