Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syngap1F6SEU4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngap1F6SEU4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms