Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod3E9QA62 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmod3E9QA62 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod3E9QA62 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms