Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms