Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm17727E9Q4V7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17727E9Q4V7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17727E9Q4V7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17727E9Q4V7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm17727E9Q4V7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm17727E9Q4V7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm17727E9Q4V7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17727E9Q4V7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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