Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms