Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myo5cE9Q1F5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Myo5cE9Q1F5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Myo5cE9Q1F5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo5cE9Q1F5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
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