Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E430018J23RikE9PZQ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms