Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sbf2E9PXF8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbf2E9PXF8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms