Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc62E9PVD1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc62E9PVD1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc62E9PVD1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms