Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim5E9PV98 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim5E9PV98 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim5E9PV98 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms