Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde2E9PUP1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syde2E9PUP1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syde2E9PUP1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms