Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb3D3Z6J4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms