Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms