Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SafbD3YXK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SafbD3YXK2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SafbD3YXK2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms