Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn24D3YXJ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn24D3YXJ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn24D3YXJ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms