Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf172C9J069 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms