Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CatipB9EKE5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CatipB9EKE5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CatipB9EKE5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms