Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apol6B7ZC55 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Apol6B7ZC55 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apol6B7ZC55 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms