Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700018F24RikB2RW27 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700018F24RikB2RW27 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms