Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a28B2RT89 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms