Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mbd5B1AYB6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mbd5B1AYB6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mbd5B1AYB6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms