Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nfx1B1AY10 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfx1B1AY10 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms