Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Supt3B0QZW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Supt3B0QZW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms