Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef25A2ASI9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms