Protein–RNA interactions for Protein: A2APB8

Tpx2, Targeting protein for Xklp2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpx2A2APB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpx2A2APB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpx2A2APB8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpx2A2APB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpx2A2APB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpx2A2APB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpx2A2APB8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpx2A2APB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpx2A2APB8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpx2A2APB8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms