Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc183A2AJB1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc183A2AJB1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms