Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc163A2AGD7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc163A2AGD7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms