Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc112A0AUP1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc112A0AUP1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms