Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms