Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2210011C24RikA0A087WQ89 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms