Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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