Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ubox5-201ENSMUST00000028761 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ptk2-209ENSMUST00000226988 4444 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms